广州医科大学药物研发中心的前身为“药物研究中心”，2015年8月正式获批更名为“药物研发中心”，是学校及药学院重点建设的创新药物研究与开发平台，设有药物设计与开发研究室和药物化学生物学研究室。中心以创新药物的基础研究与应用开发为主，主要研究领域是：药物设计与合成、药物化学、天然产物化学、化学生物学、药物筛选与评价等。

药物研发中心现有教师和科研人员22名(教授8名、副教授4人),在站博士后3名，博士研究生4名，硕士研究生30余名。中心相关教师及科研人员先后获得了广东省自然科学杰出青年基金、青年珠江人才计划、广东省青年拔尖人才、“岭南英杰工程”国家级后备人才等多个针对优秀科研人才的项目资助及称号。

近年来，中心也承担着国家自然科学基金、中科院青年创新促进会基金、广东省教育厅创新团队项目、广东省自然科学基金、广州市岭南英杰工程等20余项科研课题，在Nature、PNAS、Cell Res、Chem、ACIE、JACS、JMC、Chem. Soc. Rev.等国际权威杂志上发表SCI科研论文200余篇，申报国内外发明专利20余项，转让总金额超5000万元（里程碑式支付），获得1.1类新药临床试验批文两项（其中一项正处于II期临床试验当中）。此外，药研中心还承担药学专业研究生的培养和本科生的教学工作，近年来培养本科毕业实习生和本科科研兴趣小组40余人。

药物研发中心具有良好的研究条件，实验室拥有Q Exactive™ HF 组合型四极杆-Orbitrap 液质联用仪， Agilent 6460三重四级杆液质联用仪，Agilent气相色谱－质谱联用仪，Rudolph自动旋光仪，Agilent 1290超高效液相色谱仪， Agilent 1200液相色谱仪，Cell Insight CX7 高内涵成像分析系统，SMC×PRO单分子免疫检测仪，DMi8倒置荧光显微镜，Tripos 药物设计与分子模拟软件系统，Lauda低温反应器（-55 ℃～200 ℃）等仪器设备。